科學(xué)家們?cè)u(píng)估外星球是否可能存在生命時(shí)第一個(gè)考慮的因素就是水，進(jìn)一步的，再考慮是否存在液態(tài)水。畢竟，地球上降水豐富的熱帶雨林生命豐富多彩，缺水的沙漠可就難覓生命的跡象了。最近實(shí)驗(yàn)室在提取土壤DNA時(shí)發(fā)現(xiàn)提取到的DNA濃度時(shí)高時(shí)低，懷疑是土壤樣本的差異造成的。土壤都是在實(shí)驗(yàn)室附近的池塘邊采集的，雖然不是同一位置，但都是池塘邊的土壤，會(huì)有這么大的差異嗎？為了一探究竟，小新在池塘邊同一方向的位置采集了三份土壤樣本，分別是池塘邊的土壤、距離池塘邊0.5 m位置的土壤、距離池塘邊1 m位置的土壤，然后同時(shí)用Simgen土壤DNA純化試劑盒提取土壤DNA，讓我們一起來(lái)看看結(jié)果如何。

一、 實(shí)驗(yàn)?zāi)康?/span>

測(cè)試同一區(qū)域不同含水量土壤DNA提取的濃度差異。

二、 實(shí)驗(yàn)材料

1. 新鮮挖掘的土壤（臨近池塘、距離池塘0.5 m、距離池塘1 m）、1.5 ml離心管和2 ml離心管若干

2. 土壤DNA純化試劑盒（Simgen Cat.No.4102050）、DL15000 Ladder（Simgen Cat.No.MD1007）

3. 臺(tái)式離心機(jī)（eppendorf centrifuge 5415 D）、旋渦振蕩器（越新儀器，XH-C）、水浴鍋（上海宜昌儀器紗篩廠）、超微量分光光度計(jì)（Simgen Cat.No.sim-100）、電泳儀（北京六一儀器廠，DYY-6C型）

三、 實(shí)驗(yàn)方法

1. 稱取500 mg土壤，加入到2 ml樣品管中。加入1 ml Buffer PD，旋緊管蓋，在旋渦振蕩器上劇烈旋渦振蕩10分鐘。

2. 加入20 μl蛋白酶K貯存液，蓋上管蓋混勻，70°C水浴15分鐘。水浴期間每隔5分鐘劇烈旋渦振蕩30秒。

3. 加入200 μl Buffer ST, 劇烈旋渦振蕩30秒混勻，13000 rpm離心10分鐘。

4. 吸取上清（約1 ml左右）轉(zhuǎn)移到另一個(gè)潔凈的有蓋2 ml離心管中。

5. 加入800 μl異丙醇，溫和地翻轉(zhuǎn)4~6次混和均勻。13000 rpm離心10分鐘。

6. 棄上清，3000 rpm離心5-10秒使殘留的上清液聚集到離心管底部。用移液器吸盡殘留的上清液，保留管底沉淀。

7. 加入100 μl 70℃溫育的Buffer TE，旋渦振蕩直至沉淀全部溶解。

8. 加入500 μl Buffer P，溫和地翻轉(zhuǎn)4~6次混和均勻。吸取混合液加入到核酸純化柱中，蓋上管蓋，12000 rpm離心30秒。

9. 棄2 ml離心管中的濾液，將核酸純化柱置回到2 ml離心管中，在核酸純化柱中加入600 μl Buffer WB，蓋上管蓋，12000 rpm離心30秒。

10. 棄2 ml離心管中的濾液，將核酸純化柱置回到2 ml離心管中，13200 rpm離心2分鐘。

11. 棄2 ml離心管，將核酸純化柱置于一個(gè)潔凈的1.5 ml離心管中，在純化柱的膜中央加入100 μl 70℃溫育的Buffer TE，蓋上管蓋，室溫靜置1分鐘，12000 rpm離心30秒得到DNA。

四、 實(shí)驗(yàn)結(jié)果

1. 在超微量分光光度計(jì)上用Buffer TE調(diào)零，測(cè)量洗脫下來(lái)的DNA，結(jié)果如下：

2. 在1%的瓊脂糖凝膠上加入5 μl洗脫的DNA進(jìn)行電泳，結(jié)果如下：

 M：Simgen DL15000 Ladder

 1、2：靠近池塘的土壤提取的DNA

 3、4：距離池塘0.5 m的土壤提取的DNA

 5、6：距離池塘1 m的土壤提取的DNA

五、 分析與討論

1. 由濃度測(cè)量結(jié)果及電泳圖可知，距離池塘1 m處的土壤提到的DNA濃度最高，其次是靠近池塘處的土壤，而在中間位置也就是距離池塘0.5 m處的土壤提到的DNA濃度最低。由此可見，即使相鄰很近的土壤，其提取的DNA也會(huì)存在很大差異，這也能解釋實(shí)驗(yàn)室之前提取土壤DNA時(shí)為什么濃度時(shí)高時(shí)低了。

2. 沒有進(jìn)行實(shí)驗(yàn)測(cè)試前我們想當(dāng)然地認(rèn)為靠近池塘邊的土壤水含量高，微生物含量高，相應(yīng)的DNA含量自然也高。然而經(jīng)過(guò)本次實(shí)驗(yàn)測(cè)試說(shuō)明土壤中的微生物的生長(zhǎng)狀況肯定不是只由土壤中水的含量決定的，應(yīng)該還受到了溫度、酸堿度、氧含量、腐殖質(zhì)含量等各種因素的影響。甚至還有一種可能：在靠近池塘的土壤中聚集了一群大量需水且厭氧的微生物，遠(yuǎn)離池塘的土壤中聚集了一群耐干旱卻好氧的微生物，兩個(gè)不同喜好的微生物群擴(kuò)張相遇的時(shí)候會(huì)互相掐架，釋放各種生化武器，導(dǎo)致中間地帶最不討好，微生物含量最低。