近來有用戶反映Simgen的2×SYBR Green PCR Mix(7106100)產(chǎn)品做PCR檢測,與某公司的SYBR Green Mix相比較,發(fā)現(xiàn)有CT值有增大的現(xiàn)象,這是為什么呢?
小編經(jīng)過深入研究,發(fā)現(xiàn)當選用 2×SYBR Green PCR Mix Ⅱ配合用戶的引物PCR檢測時,CT值就與某公司的SYBR Green Mix幾乎一致了。原來2×SYBR Green PCR Mix(7106100)是追求高特異性的產(chǎn)品;而2×SYBR Green PCR Mix Ⅱ則是追求高靈敏度的產(chǎn)品--但是它對于引物的要求會比較高,如果引物設計得不好,在PCR的過程中,模板起始濃度較低時很容易出現(xiàn)非特異擴增,下面就讓小編給大家介紹一下這兩款產(chǎn)品的優(yōu)點及不足:
下面是兩款產(chǎn)品實例測試:
PCR體系配置
2×SYBR Green PCR Mix的標準曲線
從上圖所述,2×SYBR Green PCR Mix(7106100)的相關系數(shù)高達0.999,而且重復性高。
2×SYBR Green PCR Mix Ⅱ(7107100)的標準曲線
從上圖所述,2×SYBR Green PCR MixⅡ在高濃度模板時,相關系數(shù)高達0.999,重復性高;但是引物設計不完美時,一旦有低模板濃度,就會出現(xiàn)非特異擴增,從而降低相關系數(shù)。
CT值表
從CT值表格及融解曲線看,可看出2×SYBR Green PCR MixⅡ在靈敏度上比2×SYBR Green PCR Mix(7106100)會高出0.5-1個CT值左右,但是在低濃度模板時(10-7),2×SYBR Green PCR MixⅡ的CT值出現(xiàn)異常,這是因為在引物設計的不是很好時,2×SYBR Green PCR MixⅡ在低濃度模板時易出現(xiàn)非特異擴增。
綜上所述,2×SYBR Green PCR Mix(7106100)的特異性比2×SYBR Green PCR Mix Ⅱ高,但是在靈敏度上不如2×SYBR Green PCR MixⅡ。所以倘若追求高特異性,小編推薦使用2×SYBR Green PCR Mix(7106100),如果追求靈敏度,還是推薦使用2×SYBR Green PCR MixⅡ。
新景生物實驗室