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如何從種子中提取DNA(技術(shù)文章)

作者:新景實(shí)驗(yàn)室
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從種子中提取DNA

實(shí)驗(yàn)材料:黃豆、面粉、研缽、植物DNA試劑盒(Simgen,Cat.No.3201050

實(shí)驗(yàn)方法:

本次實(shí)驗(yàn)采用Simgen植物DNA試劑盒方法來提取種子中的DNA,步驟如下:

1. a.黃豆:

稱取黃豆1顆(約200mg),放入研缽中研磨至粉末狀,加入1.5 ml 65℃預(yù)熱的Buffer PL,繼續(xù)研磨,分別吸取600 μl溶解物加入2個(gè)1.5 ml 離心管(相當(dāng)于每次從約100mg 黃豆中提取DNA;

   b.面粉(小麥粉):

2個(gè)1.5 ml 離心管中分別稱取100mg200mg面粉,加入500ml 65℃預(yù)熱的Buffer PL,旋渦震蕩至充分溶解;

2. 65℃水浴10分鐘,水浴期間每隔2~3分鐘翻轉(zhuǎn)離心管數(shù)次以幫助DNA的釋放

3. 加入350 μl Buffer K,蓋上管蓋,用力搖晃15秒,渦振蕩30秒。13000 rpm離心5分鐘;

4.將離心上清液倒入核酸純化柱中,離心去濾液;

5. 依次用500 μl Buffer WA600 μl Buffer WB過柱洗滌;

6. 最高速離心,去除純化柱上殘留的乙醇;

7. 將核酸純化柱置于一個(gè)潔凈的1.5ml離心管中,60 μl 65℃預(yù)熱的Buffer TE 洗脫DNA;

8. 在微量紫外分光光度計(jì)上測(cè)量DNA的濃度;

9. 瓊脂糖凝膠電泳。

實(shí)驗(yàn)結(jié)果:

1. 在微量紫外分光光度計(jì)上用Buffer TE調(diào)零,測(cè)量洗脫下來的DNA,結(jié)果如下


2. 0.6%的瓊脂糖凝膠上,加入8μl提取到的DNA,電泳30 分鐘,結(jié)果如下


討論與分析:

1.Simgen植物DNA試劑盒能提取到黃豆、面粉(小麥粉)的DNA,說明在干燥的種子中,DNA保存得比較完整。

2.面粉DNA的電泳條帶顯示有明顯的拖尾現(xiàn)象,產(chǎn)生了類似凋亡細(xì)胞的DNA帶型。推測(cè)是由于種子被磨碎后,DNA更容易失去組蛋白的保護(hù),從而形成凋亡細(xì)胞的DNA帶型

3.由于植物種子中DNA含量較低,可適度提高樣本的用量(以面粉DNA提取為例)但樣本用量不應(yīng)大于200mg。200 mg面粉提取DNA為例,樣本加入裂解液(Buffer PL)水浴后變得非常粘稠,操作變得困難,且DNA回收量與100mg相比也沒有成倍地增長。

4.植物種子通常會(huì)含有大量的蛋白、油脂、多糖(淀粉為主),Simgen植物DNA試劑盒在提取過程能很好地抵御這些干擾。

Simgen實(shí)驗(yàn)室