一、材料:
1. 樣本:鳥(niǎo)羽毛,由客戶提供。
2. 微量DNA提取試劑盒(Simgen,Cat.No.3102050)
4. PCR擴(kuò)增試劑、引物為杭州新景生物試劑開(kāi)發(fā)有限公司自配或委托上海**生物技術(shù)有限公司合成。
5. PCR儀:Techne FPROGO5Y Progene Thermal
6. 離心機(jī):Thermo Biofuge pico
二、方法:
1. 用Simgen微量DNA提取試劑盒分離純化鳥(niǎo)羽毛中的DNA。
2. 按下列組分配制PCR檢測(cè)試劑( 40 μl反應(yīng)體系):
Master Mix(2×) 20.0 μl
上游引物FP 1.0 μl
下游引物RP 1.0 μl
dd H2O 13 μl
向每個(gè)PCR反應(yīng)管中加入35 μl反應(yīng)混合液,再加入5μl分離純化的DNA進(jìn)行PCR檢測(cè)。
注:陽(yáng)性對(duì)照用公鳥(niǎo)和母鳥(niǎo)的DNA作為模板,陰性對(duì)照用dd H2O作為模板。
3. PCR循環(huán)條件設(shè)置:
4. 瓊脂糖凝膠電泳25 min。
三、結(jié)果判定:
有效性原則
1. 陰性對(duì)照:無(wú)擴(kuò)增條帶。
2. 陽(yáng)性對(duì)照:公的對(duì)照有一條擴(kuò)增條帶,母的對(duì)照有兩條擴(kuò)增條帶。
以上要求必須同時(shí)滿足,否則本次檢測(cè)無(wú)效。
結(jié)果:
1. 送檢的鳥(niǎo)羽毛鑒定為公鳥(niǎo)的羽毛。
2. 結(jié)果分析:
(1) 從電泳圖中的陽(yáng)性對(duì)照可以看出公鳥(niǎo)擴(kuò)增產(chǎn)物只有一條明顯可見(jiàn)的條帶,母鳥(niǎo)擴(kuò)增產(chǎn)物有兩條明顯可見(jiàn)的條帶。
(2) 從電泳圖中可以看出送檢羽毛提取的DNA擴(kuò)增產(chǎn)物有一條明亮的條帶和一條暗淡幾乎不可見(jiàn)的條帶,與公的陽(yáng)性對(duì)照較為符合,判斷送檢羽毛為公鳥(niǎo)的羽毛。而另一條隱約可見(jiàn)的條帶推測(cè)是母鳥(niǎo)樣本污染所致,例如公鳥(niǎo)長(zhǎng)期與母鳥(niǎo)關(guān)在一起,羽毛上可能沾染有母鳥(niǎo)的碎屑,導(dǎo)致擴(kuò)增出較暗的第二條帶,當(dāng)減少PCR擴(kuò)增循環(huán)次數(shù)后,這種污染條帶將更加暗淡不可見(jiàn)。
PCR擴(kuò)增結(jié)果電泳圖: